Dozent

Prof. Dr. Hans-Peter Lenhof

Assistenten

Übungsleiter

Teilgebiete

Vorkenntnisse Wichtig

Voraussetzung zur Scheinvergabe

Weiterführende Veranstaltungen

Bioinformatik III

Anmeldung zur Vorlesung und Klausur

Um an der Vorlesung teilzunehmen, müssen Sie sich hier per E-Mail anmelden. Dies ist keine Anmeldung zur Klausur! Hierzu müssen Sie sich zusätzlich spätestens eine Woche vor der Klausur bzw. Nachklausur hier anmelden.

Geben Sie bei Ihrer Anmeldung folgende Daten an:

Vermittelte Fähigkeiten

Grundfertigkeiten der Bioinformatik sollen in dieser Vorlesung vermittelt werden. Den Studentinnen und Studenten werden in der Vorlesung die grundlegenden Probleme und Fragestellungen der Bioinformatik vorgestellt werden. Sie sollen lernen, wie man diese Probleme mathematisch modellieren und mit Hilfe der Methoden der Bioinformatik lösen kann.

Vorlesung

Vorlesungsbeginn
Donnerstag, 20.04.2017
Termine
Dienstag, 14:00 - 16:00 Uhr, Gebäude E2.1, Hörsaal 007
Donnerstag, 14:00 - 16:00 Uhr, Gebäude E2.1, Hörsaal 007
Fragestunde
Montag, 10:00 - 11:00 Uhr, Gebäude E2.1, Raum 416

Übung

Übungsbeginn
Dienstag, 18.04.2017, 16:00 - 18:00 Uhr, erste Übung im CIP-Pool (003), Gebäude E2.1
Termine
Montag, 16:00 - 17:45, Gebäude E2.1, Hörsaal 007
Office Hour
Mittwoch, 13:00 - 15:00 Uhr, Gebäude E.21, Raum 413

Präsentationen Docking-Challenge

Termin
Donnerstag, 06.07.2017, 14:00 - 16:00 Uhr, Gebäude E2.1, Hörsaal 007

Klausur

Hauptklausur
Dienstag, 18.07.2017, 14:00 - 16:00 Uhr, Gebäude E2.1, Hörsaal 007 Neuer Termin
Einsicht
Mittwoch, 19.07.2017, 14:00 - 16:00 Uhr, Gebäude E2.1, Hörsall 007
Nachklausur
Dienstag, 17.10.2017, 14:00 - 16:00 Uhr, Gebäude E2.1, Hörsaal 007
Um an der Nachklausur teilzunehmen, melden Sie sich bitte zusätzlich bis zum 10.10.2017 hier per E-Mail an.
Einsicht
Nach Vereinbarung

Vorlesungsfolien

Datum Themen Folien
20.04. Introduction to Protein Structure PDF PPTX
Secondary Structure Assessment PDF PPT
27.04. Secondary Structure Prediction PDF PPT
04.05. Threading PDF PPT
09.05. Homology Modelling PDF PPT
18.05. De Novo Sturkturvorhersage PDF PPT
23.05. Molekulare Superpositionierung PDF
30.05. Docking I PDF PPTX
01.06. Docking II PDF PPTX
06.06. Docking IIB PDF PPTX
08.06 Docking Challenge HTML
20.06. Docking III PDF PPTX
22.06. Drug Screening PDF PPTX
29.06. Microarray Analysis Part 1 PDF PPT
Microarray Analysis Part 2 PDF PPT
13.07. GeneTrail PDF PPTX

Übungen

Übung Abgabe Materialien
1 27.04.17
2 04.05.17
3 11.05.17
4 18.05.17
5 25.05.17
6 01.06.17
7 08.06.17
Docking Challenge 29.06.17
8 06.07.17
9 13.07.17
Klausurthemen

Wie kann ich von zuhause aus auf den CIPs arbeiten?

Dies geht am einfachsten per Secure Shell (SSH). Verwenden Sie dazu einfach eine Linux Shell und/oder einen graphischen Client. Dann können Sie sich mittels

ssh username@bioXX.studcs.uni-sb.de
auf einem der CIP Rechner einloggen. Windows Clients sind: Unter Linux und MacOS X verwenden Sie am einfachsten die Kommandos ssh und scp.