Dozent

Prof. Dr. Hans-Peter Lenhof

Assistent

Übungsleiter

Teilgebiete

Vorkenntnisse Wichtig

Voraussetzung zur Scheinvergabe

Weiterführende Veranstaltungen

Bioinformatik III

Anmeldung zur Vorlesung und Klausur

Um an der Vorlesung teilzunehmen, müssen Sie sich hier per E-Mail anmelden. Dies ist keine Anmeldung zur Klausur! Hierzu müssen Sie sich zusätzlich spätestens eine Woche vor der Klausur bzw. Nachklausur hier anmelden.

Geben Sie bei Ihrer Anmeldung folgende Daten an:

Vermittelte Fähigkeiten

Grundfertigkeiten der Bioinformatik sollen in dieser Vorlesung vermittelt werden. Den Studentinnen und Studenten werden in der Vorlesung die grundlegenden Probleme und Fragestellungen der Bioinformatik vorgestellt werden. Sie sollen lernen, wie man diese Probleme mathematisch modellieren und mit Hilfe der Methoden der Bioinformatik lösen kann.

Vorlesung

Vorlesungsbeginn
Donnerstag, 07.05.2020
Termine
Dienstag, 14:00 - 16:00 Uhr, ZOOM
Donnerstag, 14:00 - 16:00 Uhr, ZOOM
Fragestunde
Montag, 9:00 - 10:00 Uhr, ZOOM

Übung

Übungsbeginn
Erste Übung, Montag 04.05.2020 14:00-18:00
Termine
Montag 14:00-16:00, ZOOM
Office Hours
  • Montag 11:00-12:01, Tim Kehl
  • Dienstag 10:00-11:00, Georg von Arnim
  • Dienstag 17:00-18:00, Hanna Nebelung
  • Mittwoch 09:00-10:00, Nico Gerstner
  • Freitag 09:00-10:00, Kerstin Lenhof

Klausur

Hauptklausur
Steht aufgrund der aktuellen Lage noch nicht fest
Einsicht
TBA
Nachklausur
Steht aufgrund der aktuellen Lage noch nicht fest
Um an der Nachklausur teilzunehmen, melden Sie sich bitte zusätzlich bis zum 06.10.2020 hier per E-Mail an.
Einsicht
Nach Vereinbarung

Vorlesungsfolien

Datum Themen Folien
07.05. Covid19 PDF PPTX
12.05. Introduction to Protein Structure PDF PPTX
14.05. Secondary Structure Assessment PDF PPTX
26.05. Secondary Structure Prediction PDF PPTX
02.06. Deep Learning PPTX
04.06. Threading PDF PPTX
16.06. Molekulare Superpositionierung PDF
25.06. Homology Modelling PDF PPTX
25.06. AlphaFold PDF PPTX
30.06. Microarray Analysis Part 1 PDF PPTX
02.07. Microarray Analysis Part 2 PDF PPTX
09.07. Docking I PDF PPTX
14.07. Docking II PDF PPTX
16.07. Docking IIB PDF PPTX
16.07. Docking III PDF PPTX

Wie kann ich von zuhause aus auf den CIPs arbeiten?

Dies geht am einfachsten per Secure Shell (SSH). Verwenden Sie dazu einfach eine Linux Shell und/oder einen graphischen Client. Dann können Sie sich mittels

ssh username@bioXX.studcs.uni-sb.de
auf einem der CIP Rechner einloggen. Windows Clients sind: Unter Linux und MacOS X verwenden Sie am einfachsten die Kommandos ssh und scp.