Inhalt

In diesem Seminar werden interessante Arbeiten und Algorithmen der Bioinformatik behandelt, die im Bereich der Therapieoptimierung zur Krebsbehandlung und der personalisierten Medizin Anwendung finden. Das Seminar wird als Block-Seminar in der Woche vor Vorlesungsbeginn des Wintersemesters gehalten.

Dozent

Prof. Dr. Hans-Peter Lenhof

Betreuer

Voraussetzungen

Bedingungen zum Scheinerhalt

Anmeldung

Um am Seminar teilnehmen zu können, muss man beim Themenvergabe-Treffen persönlich anwesend sein. Dabei werden die Themen, ggf. per Losverfahren, verteilt.
Vorherige Anmeldung oder Themenreservierung ist nicht möglich.

# Paper Autoren Redner Betreuer
1 Discovery of drug mode of action and drug repositioning from transcriptional responses Iorio et al. Kristina Thedinga Lara Schneider
2 Rank–rank hypergeometric overlap: identification of statistically significant overlap between gene-expression signatures Plaisier et al. Mark Bauer Tim Kehl
3 'N-of-1-pathways' unveils personal deregulated mechanisms from a single pair of RNA-Seq samples: towards precision medicine Gardeux et al. Markus Dillmann Tim Kehl
4 A novel significance score for gene selection and ranking Xiao et al. Jonas Waas Lara Schneider
5 Network-based prediction for sources of transcriptional dysregulation using latent pathway identification analysis Pham et al. Lea Eckhart Tim Kehl
6 Inconsistency in large pharmacogenomic studies Haibe-Kains et al. Friederike Grandke Tim Kehl
7 Estimating cancer survival and clinical outcome based on genetic tumor progression scores Rahnenführer et al. Alexander Flohr Lara Schneider
8 A novel signaling pathway impact analysis Tarca et al. Geri Golemi Lara Schneider
9 FERAL: network-based classifier with application to breast cancer outcome prediction Allahyar et al. Jeremy Amand Lara Schneider
Themenvergabe
Freitag, 22.07.2016, 16:00 Uhr, Gebäude E2.1, Raum 406
Deadline Ausarbeitung
Mittwoch, 07.09.2016, 23:59 Uhr
Deadline Folien
Mittwoch, 05.10.2016, 23:59 Uhr
Vorträge
Dienstag, 18.10.2016, 9:00 Uhr - 12:00 Uhr, Gebäude E2.1, Raum 406
Mittwoch, 19.10.2016, 9:00 Uhr - 12:00 Uhr, Gebäude E2.1, Raum 406

Checkliste für Folien

Checkliste für Bericht

Zusatzmaterial

  1. How to give a scientific presentation (Susan McConnell) PDF PPT
  2. The Craft of Scientific Presentations (Michael Alley)