Inhalt

In diesem Seminar werden interessante Arbeiten und Algorithmen der Bioinformatik behandelt, die im Bereich der Therapieoptimierung zur Krebsbehandlung und der personalisierten Medizin Anwendung finden. Das Seminar wird als Block-Seminar in der Woche vor Vorlesungsbeginn des Wintersemesters gehalten.

Dozent

Prof. Dr. Hans-Peter Lenhof

Betreuer

Voraussetzungen

Bedingungen zum Scheinerhalt

Anmeldung

Um am Seminar teilnehmen zu können, muss man beim Themenvergabe-Treffen persönlich anwesend sein. Dabei werden die Themen, ggf. per Losverfahren, verteilt.
Vorherige Anmeldung oder Themenreservierung ist nicht möglich.
Bitte bestätigen Sie Ihre Seminarteilnahme bis zum 11. August 2017 per Mail an lschneider@bioinf.uni-sb.de.
Außerdem müssen Sie sich bis zum 25. August 2017 verbindlich im HISPOS anmelden.

# Paper Autoren Redner Betreuer
1 Discovery of drug mode of action and drug repositioning from transcriptional responses Iorio et al. Jana Heß Lara Schneider
2 Inferring Pathway Activity toward Precise Disease Classification Lee et al. Christina Eimer Tim Kehl
3 A novel signaling pathway impact analysis Tarca et al. Anke King Lara Schneider
4 TANDEM: a two-stage approach to maximize interpretability of drug response models based on multiple molecular data types Aben et al. Jennifer Czaja Lara Schneider
5 Drug response prediction by inferring pathway-response associations with kernelized Bayesian matrix factorization. Ammad-Ud-Din et al. Max Schmitt Lara Schneider
6 Logic models to predict continuous outputs based on binary inputs with an application to personalized cancer therapy Knijnenburg et al. Berit Andres Tim Kehl
Themenvergabe
Freitag, 04.08.2017, 16:00 Uhr, Gebäude E2.1, Raum 406
Deadline Ausarbeitung
Dienstag, 29.08.2017, 23:59 Uhr
Deadline Folien
Dienstag, 19.09.2017, 23:59 Uhr
Vorträge
Mittwoch, 11.10.2017, 10:00 Uhr - 13:00 Uhr, Gebäude E2.1, Raum 406
Donnerstag, 12.10.2017, 10:00 Uhr - 13:00 Uhr, Gebäude E2.1, Raum 406

Checkliste für Folien

Checkliste für Bericht

Zusatzmaterial

  1. How to give a scientific presentation (Susan McConnell) PDF PPT
  2. The Craft of Scientific Presentations (Michael Alley)